新的财会制度也要求各地卫生主管部门加强对医疗单位的监管，落实新医改精神，解决人民群众看病难看病贵的问题。加强对下级单位的财务管理，保障医疗机构财务行为跟会计核算合法科学，规范，透明。
面对业务发展趋势，在信息化中目前主要面临内部核算体系不统一，财务制度无法落实、汇总统计困难，上下级财务信息不透明，财务信息真实性遭到质疑，上级卫生监控不及时，财务管理仍停留在事后管理，软件业务流程不连贯，预算、核算、决算等业务割裂，项目、资金管理不全面，相关业务信息难以全程跟踪，多种软件平台不一致，数据收集困难、升级维护成本巨大等问题，在信息化方面虽然许多单位利用信息技术在规范会计核算，加强事后财务监督和审计方面取得了较大成绩；但为了把计划财务管理提高到新的水平，就不仅要做好事后的记账、编报表，还要做好事前的预算编制、事中的执行控制、事后的评价分析。
解决方案以建立财务集中监管平台为目标，打破卫生主管部门与各个基层医疗卫生机构、医院之间的信息壁垒，整合各个下级卫生单位财务管理、会计核算、项目预算管理的业务需求，实现信息的集成化管理。方案满足新的医院和基层医疗机构财务会计制度，将统一规范卫生行业核算体系，清晰反映财政卫生补偿机制，支持修正的收付实现制，体现基本药物零差价改革；支持基层卫生机构收支两条线管理，实现数据集中、信息共享，支持实时数据挖掘、实时监管、智能决策分析，实现自定义分级、自定义汇总方式、自定义分析方法的网络直报，为卫生厅局的宏观管理提供有力保障。
特别是在公立医院成本核算与绩效管理等高端运营管理领域，支持卫生机构全面预算管理，全成本核算管理，实现成本核算、支持自动式智能化成本分摊，支持各类复杂的医院绩效管理模型和奖金核算办法，为医疗卫生机构的精细化内控提供有力的信息化保障。
